Gò Công Đông là huyện ven biển lại ở cuối nguồn của Dự án ngọt hóa nên vào mùa khô, gió chướng (gió mùa Đông Bắc) đẩy mặn xâm nhập sâu vào đất liền, nước mặn từ biển Đông lấn sâu lên thượng nguồn, thời điểm này, mực nước trong nội đồng bị cạn kiệt và ô nhiễm nặng, do đó nước phục vụ cho sinh hoạt của người dân đang là mối quan tâm lớn của địa phương.